為使台灣動物保護政策能專業、落實，台灣動物社會研究會與平民法權促進會等團體，目前共同發起推動中央主管機關設置動物保護一級單位的連署行動，希望能推動立法院在審議行政院農業委員會組織法修正案時，能設置執掌動物保護事務之一級單位，或至少以附帶決議方式，要求農委會增設「動物保護科」，以專業落實台灣動物保護的工作。
動物社會研究會表示：目前歐洲多數國家，例如德國、法國、瑞士、瑞典、荷蘭、奧地利、芬蘭、挪威、比利時、匈牙利、捷克、克羅埃西亞、波蘭、賽浦路斯、葡萄牙、丹麥和英國等，均於中央政府農業部下設動物福利科(Animal Welfare Div.) 或類似單位， 並以具動物福利或獸醫科學素養人士擔任主管，專責推動提昇動物福利工作。
而在台灣，動物保護法相關業務屬於行政院農業委員會畜牧處畜牧行政科執掌。目前畜牧行政科的人力，正式人員為科長一名，編制內行政人員四名，中部辦公室調部辦事人員二名，以上一共七名，再加上一名已約聘人員，以及正在招募中的約聘人員，總共有九名人員。而預算之編列，除中央統籌款需補助地方之外，中央機關約為六千萬，其中－－
屬於 畜 牧 法 的部份：中央機關為350萬，中央統籌款補助地方為470萬。
屬於飼料管理法的部份：中央機關為890萬，中央統籌款補助地方的部份為600萬。
屬於動物保護法的部份：中央機關為4100萬，中央統籌款補助地方為2500萬。
由以上預算的編列可知，動物保護為畜牧行政科的重點項目，但全科只有九個人，亦不可能全部投入動物保護工作，若只拿現今台灣地區百萬以上的流浪動物數量與之相比，顯然嚴重不足，更遑論其他動物生命福祉的照顧。
此外就人力部份：畜牧處人力配置不足一百五十人，與其他一級單位如漁業署一千多人，動物植物防疫檢疫局一百七十人相比較，原本就較少。而畜牧行政科的人員編列只有九名，卻要負擔下列諸項業務：畜牧生產政策與法規訂定、畜牧場管理之策畫與督導、畜牧發展基金之督導管理、畜牧團體之指導及監督、推動畜牧國際合作及人才交流與訓練計畫等，以及與動物保護相關的業務。
再就業務量來看，單薄的人力是否足以負擔，已令人存疑，更何況畜牧行政與動物保護，在專業上本就不同，一以經濟為考量，以產業盈餘累積的多寡為重點；另一則以人道水平為考量，動物福利與人類福祉兼顧為重點，施政方向暨政策目標落差甚大，應該分置不同業務單位，以擔任動物保護的繁重工作，如此將有利提昇我動物保護之水平與落實實際業務。
目前行政院已將行政院農業委員會組織法修正案提交立法院審議中，其中亦有增設一級單位之計畫，以因應畜牧法規修訂後職責變動的需求。動物保護法是一先進立法，且動物保護係屬專門業務，與畜牧之專業知識尚有不同，絕非其他領域的行政人員可兼及，故設置執掌動物保護事務之一級單位，或至少以附帶決議方式，要求農委會在畜牧處之下，增設動物保護科，執掌動物保護事項，絕對是必要且合理的建議。
動物社會研究會指出：關心動物福利，絕對與人類、環境的福利息息相關，因此希望熱心民眾能共同參與連署，共同推動中央主管機關設置執掌動物保護事務之一級單位，以致力動物保護業務與教育，讓台灣人與動物的互動能更加和諧。
共同發起團體：台灣動物社會研究會、非線性法律工作室、平民法權促進會
